DEPARTAMENTUL DE CERCETARE AL IOB CUPRINDE 3 LABORATOARE:

- LABORATORUL BIOLOGIA CANCERULUI

- LABORATORUL DE CANCEROGENEZA CHIMICA SI BIOLOGIE MOLECULARA

- LABORATORUL DE BIOCHIMIE SI RADIOBIOLOGIE

in cele ce urmeaza iata cateva cuvinte despre fiecare in parte:

 

 

- LABORATORUL BIOLOGIA CANCERULUI


Laboratorul Biologia Cancerului este constituit din trei colective ce isi desfasoara activitatea stiintifica in scopul evidentierii diferitelor modificari la nivel tisular si celular care apar in timpul oncogenezei, cercetari finalizate, in principal, prin intermediul proiectelor de cercetare.

1.    Colectivul de oncologie comparativa
    Activitati specifice:
•    producere si control genetic animale inbred, inducere si intretinere tumori experimentale;
•    depistare tumori spontane si grefarea acestora pe animale sanatoase;
•    creare modele experimentale cu scopul final de translationare a rezultatelor obtinute in clinica oncologica;
•    pastrarea puritatii genetice, teste de histocompatibilitate prin grefe de piele si alte teste specifice.

2.    Colectivul de morfopatologie
    Activitati specifice:
•    determinarea unor caracteristici morfo-patologice prin coloratii: uzuale, speciale, pe probe recoltate de la animalele de experienta;
•    determinarea prezentei sau absentei unor anticorpi specifici prin tehnici speciale de imunofluorescenta si imunohistochimie.

3.    Colectivul de morfometrie si citometrie in flux
    Activitati specifice:
•    analize clinice: imunofenotipare leucemii acute, monitorizare status imun la pacientii cu afectiuni maligne;
•    studii experimentale: analiza seturilor si subseturilor limfocitare, evaluarea efectului unor modulatori (compusi biologic activi, medicamente, citostatice) asupra ciclului celular si apoptozei, chimioterapie fotostimulata in cancer, modelare matematica.

Echipa
•    Dr. PANAIT Marieta Elena - Chimist medical principal, CS III  - Sef laborator;
•    Dr. MANOLESCU Nicolae - Medic veterinar primar, Profesor Universitar, CS I
•    Dr. BALINT Emilia Florica - Medic veterinar primar, Conferentiar universitar, CS III
•    Dr. DUMITRESCU Iolanda – Inginer calculatoare, CS III
•    Dr. FUMAREL Radu- George - Fizician principal
•    FRATILA  Daniela - Biolog medical principal, CS III
•    Dr. BUSCA Antonela - Biolog medical specialist, CS
•    Drd. COMAN Ana-Maria - Medic veterinar, asistent cercetare
•    BUDASCU Valentin - Medic veterinar, asistent cercetare
•    NITA Gheorghita Florentina - Asistent I
•    COCA Monica - Asistent debutant
•    SINCA Patrita - Muncitor calificat I
•    TOADER Alexandra - muncitor calificat III
•    POPESCU Mariana – ingrijitoare

Dotari
Microscop NIKON ECLIPSE E800 echipat cu camera foto NIKON FDX-35
Microscop NIKON ECLIPSE E 600 cu accesorii (camera foto, modul fluorescenta)
Microscop inversat de cercetare OLYMPUS IX 70
Microtom SAKURA ACCU-CUT SRM 200
Statie includere parafina BIO OPTICA DP 500
Baie termostatica BIO OPTICA UT 200
Aparat de racire BIO OPTICA PF 100
Cryostat MNT SLEE
Citometru in flux  FACSCalibur (Becton Dickinson)
Low-Capacity Tissue Dezintegrator Medimachine

 

 

- LABORATORUL DE CANCEROGENEZA CHIMICA SI BIOLOGIE MOLECULARA

Laboratorul de Cancerogeneza Chimica si Biologie Moleculara face parte din Departamentul de cercetare experimentala al institutului, directiile principale de studiu fiind corelate, in permanenta, cu cele mai noi cunostinte stiintifice din domeniul oncologiei, in special la nivel molecular.

Laboratorul a reprezentat una dintre primele structuri de cercetare experimentala din institut, fiind infiintat in anul 1954, de dr. Nicolae Voiculet, unul dintre pionierii cercetarii in oncologie, atat in Romania, cat si, nu de putine ori, pe plan international. Sub conducerea dansului, laboratorul a cunoscut o dezvoltare continua, printre domeniile abordate numarandu-se, printre altele:

  • actiunea radiatiilor nucleare asupra organismului, studii ce au condus, mai apoi, la constituirea Laboratorului de Medicina Nucleara;
  • factori de natura chimica, fizica si biologica implicati in aparitia si evolutia bolii canceroase - in acest context, este de mentionat identificarea unor compusi chimici cu rol de protectie: antiinitiatori si antipromotori, asigurandu-se astfel dezvoltarea unor metode de preventie;
  • realizarea primelor determinari de markeri tumorali: proteine receptoare pentru estrogen si progesterona;
  • studii la nivel de acizi nucleici: dezvoltarea conceptelor de factori moleculari implicati in cancer.

Dupa anul 1990, pana in anul 2015, laboratorul a fost condus de dr. Sabin Cinca, cercetator stiintific I, iar apoi, de dr. Maria-Monica Nistoroiu, cercetator stiintific I.

Pornind de la traditiile instituite de dr. Nicolae Voiculet, s-a incercat mentinerea studiilor la un nivel stiintific cat mai ridicat, printre domeniile de cercetare putandu-se mentiona:

  • cancerogeneza chimica - au fost vizati, in special agentii de natura aromatica: hidrocarburi aromatice policiclice, derivati cu azot (nitroderivati aromatici) si compusi naturali;
  • identificarea de factori de mediu implicati in protectia impotriva cancerului,
  • mecanisme de inducere si evolutie a cancerului, inclusiv identificarea unor compusi de tip ”cancerigen final” si a structurilor generate de acestia;
  • modificari structurale si functionale ale acizilor nucleici - generarea de ”aducti-ADN”, putand fi mentionata dezvoltarea unei metode originale de identificare a aductilor printr-o varianta de postmarcare cu P-32;
  • markeri tumorali - printre cele mai noi determinari din acest domeniu se numara proteinele MIA si S-100, implicate in melanom.
  • surse radioactive deschise, laboratorul incluzand in structura sa, o unitate nucleara, singura din tara dedicata studiilor acestor surse in oncologie.

Dupa anul 2000, studiile s-au axat pe domeniul biologiei moleculare a cancerului, al factorilor genetici implicati in cancer: oncogene si gene supresoare; au fost vizate, in mod deosebit, modificarile structurale (mutatii) si functionale ale acestora. Prin eforturi proprii si a fondurilor financiare asigurate din proiectele de cercetare realizate in laborator, de la o dotare relativ modesta existenta anterior, s-a reusit realizarea unui sector distinct dedicat studiilor de biologie moleculara, cu o dotare de cel mai inalt nivel, atat pe plan national, cat si european. Existenta acestei dotari, a permis dezvoltarea unor metode experimentale extrem de perfomante, inclusiv a unor determinari de tip NGS (next generation sequencing) - cea mai noua metoda de secventiere de acizi nucleici, metoda ce permite secventierea completa a unui genom.

Printre metode dezvoltate si utilizate se pot mentiona:

  • amplificari de secvente ADN de interes - se utilizeaza metode de tip PCR (polymerase chain reaction) - atat cea ”clasica”, cat si variantele ei mai noi si mai performante:
    • metoda Touchdown (Step-down) PCR - utilizata pentru reducerea amplificarii produşilor nespecifici prin scăderea graduală a temperaturii de legare a primerilor;
    • metoda ”nested PCR” reprezintă o variantă a PCR prin care se realizeaza cresterea productivitatii si a eficientei amplificarii fragmentului DNA tinta;
    • PCR-RFLP (PCR-restriction fragment length polymorphism) - utilizata pentru evidentierea mutatiilor punctiforme, insertiilor/deletiilor mici si a polimorfismelor mono-nucleare sau multiple.
  • RT-PCR (Revers Transcripţie-PCR) - spre deosebire de PCR, care permite determinarea numarului de copii ale unui fragment ADN de interes, RT-PCR este o metoda dedicata analizei expresiei genice la nivel de ARN.
  • qPCR/qRT-PCR (PCR/qRT-PCR in timp real sau PCR/qRT-PCR cantitativ) - reprezinta metode mai rapide si sensibile pentru determinari cantitative ale ADN sau ARN. Cuantificarea relativa permite compararea nivelului de expresie al unei gene in doua sau mai multe probe. Aplicatii ale tehnicii qPCR in laborator:
    • discriminarea alelica (Allelic Discrimination Assay) - permite detectia mutatiilor punctiforme si a polimorfismului mono-nuclear (SNP);
    • denaturarea de inalta rezolutie (High Resolution Melting Assay – HRMA); este o metoda foarte sensibila si specifica care permite discriminarea speciilor de acizi nucleici pe seama unor mici diferente de secventa (un singur nucleotid schimbat), ceea ce face posibila utilizarea ei pentru detectia mutatiilor, analiza de metilare si genotipare;
    • MethyLight - permite un screening rapid al statusului de metilare al insulelor CpC din ADN-ul tumoral.
  • secventierea ADN - include metode si tehnologii utilizate in scopul determinarii structurii primare a ADN; devine astfel posibila identificarea cauzelor care determina aparitia sau evolutia bolii canceroase, putandu-se adopta masuri de preventie, respectiv, de tratament cat mai specifice si mai eficiente.
  • modificari epigenetice: in contextul deplasarii, tot mai intense, a interesului de la modificarile mutagenice spre cele de tip epigenetic, au fost realizate studii ce au vizat identificarea unor modificari (metilari) in cancer colo-rectal.

Determinarile la nivel genetic au permis initierea, la nivelul institutului, a unor studii ce urmaresc realizarea unor tratamente individualizate in cancer.

Multe dintre studiile realizate in laborator sunt sau au fost incluse in Planurile de Cercetare Nationale din Romania: PN II, CEEX VIASAN, BIOTECH, NANOTECH, CERES si altele, la care se adauga proiecte de cercetare internationale: FP7, Banca Mondiala, proiecte bi-nationale: Romania - Grecia (proiect ce a permis initierea, in Romania, a studiului genelor brca).

Dupa anul 2000, laboratorul a contribuit la realizarea a peste 50 de proiecte de cercetare nationale sau internationale, majoritatea in parteneriat cu alte unitai de cercetare, dintre care, 25 au fost coordonate de cercetatori din laborator: 10 - ca director de proiect, iar 15 - ca responsabil partener.

Alaturi de activitatea de cercetare, personalul laboratorului a fost integrat si in activitati de educatie si formare profesionala, unii dintre cercetatori fiind cadre didactice asociate in invatamantul superior, ceea ce a asigurat pregatirea de studenti si masteranzi care au devenit, la randul lor cercetatori stiintifici, unii dintre acestia fiind angajati chiar in cadrul institutului.

Dotari - se mentioneaza doar cateva echipamente de ”varf”:

  • Sistem de analiza genetica multipla Light Cycler model 480 Roche - permite studii diverse, inclusiv cuantificarea expresiei genice sau identificarea unor evenimente epigenetice;
  • Sistem Fast Real-time PCR 7900HT Applied Biosystems - permite detectia calitativa si cantitativa a unor secvente de acizi nucleici, pe baza analizelor de tip ”end-point” si a curbelor de disociere;
  • echipamente PCR (Eppendorf, Applied Biosystems) - utilizate pentru amplificare de acizi nucleici;
  • sistem de electroforeza cu dispozitiv de vizualizare DigiDoc UVP - utilizat pentru separarea si identificarea de fragmente de acizi nucleici;
  • dispozitiv pentru transfer umed (blotting);
  • spectrofotometre (GBC Cyntra 10, Specord);
  • centrifugi si ultracentrifugi;
  • ultrafreezere (-96°

Colectivul laboratorului:

Dr. Maria-Monica Nistoroiu - cercetator stiintific I, sef laborator

Dr. Sabin Cinca - cercetator stiintific I, director proiect cercetare

Dr. Liliana Puiu - cercetator stiintific II

Dr. Adina Stanciu - cercetator stiintific III

Madalina Chesnoiu - cercetator stiintific III

Drd. Corina-Elena Mihalcea - cercetator stiintific

Drd. Daniela Murarasu - cercetator stiintific

Marius Apostolescu - asistent cercetare

Rodica-Ioana Stefan - ingrijitor curatenie

 

 

- LABORATORUL DE BIOCHIMIE SI RADIOBIOLOGIE

Laboratorul de Biochimie si Radiobiologie functioneaza in cadrul Institutului Oncologic din Bucuresti de la infiintarea acestuia ca un laborator de cercetare, aici desfasurandu-se o activitate de cercetare translationala, asigurandu-se toate nivelele de lucru care presupun documentarea, experimentarea si valorificarea proiectelor stiintifice. Incepand cu o cercetare fundamentala care presupune realizarea modelelor de lucru in vitro pe culturi de celule sau numai strict celule izolate din fragmente tisulare tumorale, continuand cu experimentarile in vivo pe modele animale, pana la dozarea unor parametrii biochimici din serul sau urina pacientilor in vederea stabilirii diagnosticului si a monitorizarii eficientei tratamentului oncostatic, activitatile efectuate in acest laborator vin sa completeze multitudinea si complexitatea activitatilor specifice bolii canceroase care se desfasoara in institut.

Resurse umane

Dorobantu Cristina biolog Cercetator stiintific
Dumitru Mirela inginer chimist pr./doctorand Cercetatorprincipal III
Glavan Daniela biochimist spec. Cercetator stiintific
Gruia Maria Iuliana

biochimist pr./doctor

Cercetator principal II Sef laborator

Negoita Valentina medic veterinar/doctor Cercetator stiintific
Vasilescu Maria-Monica biolog specialist / doctorand Cercetator principal III

 

In acest laborator isi desfasoara activitatea un numar de 12 persoane cu o pregatire strict specializata pentru activitatea de cercetare si anume 6 cercetatori cu studii superioare (1 cercetator principal gradul ll, 2 cp gradul lll , 3 cercetator stiintific) incadrati dupa specialitatile lor si anume 1 chimist, 2 biologi, 2 biochimisti si 1 medic veterinar, trei doctori in stiinte biologice specialitate biochimie medicina veterinara, si 2 doctoranzi. Un numar de 4 persoane sunt asistenti medicali principali cu studii superioare,. Exista si un personal auxiliar (un muncitor si un ingrijitor de curatenie) necesar desfasurarii activitatilor curente. Media de varsta este de 42 ani cuprinsa intre 56 si 27 ani. Acest numar mic de personal desfasoara atat activitate de cercetare fundamentala cat si clinica, participand la realizarea unor teste clinice de monitorizare a tratamentului cu Metotrexat in doze mari, dozari de markeri pentru depistarea precoce a metastazelor osoase (raportul hidroxiprolina / creatinina), de prognostic pentru melanomul malign (acidul sialic) precum si parametrii biochimici de stres oxidativ (MDA, Ceruloplasmina, tioli albuminici, FRAS), teste clinice, (CIC complexe imune circulante) care nu se efectueaza in alte unitati spitalicesti prin metodele adaptate si verificate din literatura de specialitate in laboratorul nostru.

Programe de cercetare

 1. Coordonator Universitatea de Medicina si Farmacie „Carol Davila” Bucuresti

Programul: Parteneriate in domenii prioritare

Domeniul:  6. Biotehnologii

Acronim proiect: RuSYST

Contract nr:136/ 2012

Subcontractor / partener 1 Institutul Oncologic „Prof. Dr. Alex. Trestioreanu” Bucuresti in calitate de partener (P1) al proiectului: „Conceperea si dezvoltarea unor sisteme de transport si cedare pentru noi compusi de ruteniu cu actiune antitumorala

2. Platforma technologica avansata pentru studii preclinice ale radiofarmaceuticelor; ACRONIM: RadIOMED, in cadrul programului CAPACITATI, Modulul III, Romania-CERN (RO-CERN (ELI-NP; FAIR)).

3. Programul Operational Capital Uman 2014 - 2020 (POCU) 

 I.  ANUNT SELECTIE PARTENERI

ANEXA 1 - Scrisoare de intentie

ANEXA 2 - Fisa de partener

ANEXA 3 - Grila de evaluare: etapa de calificare a participantilor

ANEXA 4 - Grila de evaluare si selectare a participantilor

II.  ANUNT REZULTAT SELECTIE PARTENERI

 

III. ANUNT PARTENERI

IV. ANUNT SELECTIE PARTENERI

ANEXA 1 - Scrisoare de intentie

ANEXA 2 - Fisa de partener

ANEXA 3 - Grila de evaluare: etapa de calificare a participantilor

ANEXA 4 - Grila de evaluare si selectare a participantilor

V. Anunt cu privire la rezultatul procedurii de selectie a partenerilor nationali si transnationali